在案例一中，國有公司和物資公司合意提升鋼材價(jià)格、變更鋼材款的結算支付期限，實(shí)際是因為國有公司未能及時(shí)支付貨款，為了賠償物資公司的損失而對工程價(jià)款和結算方式進(jìn)行的變更約定，其實(shí)質(zhì)為關(guān)于損失賠償的約定，屬于合同履行過(guò)程中的正常變更。并不屬于招投標過(guò)程中的“黑合同”，應當認定為有效變更，可以作為雙方結算鋼材款的依據。

在案例二中，項目公司的股權結構實(shí)際上不影響股東對外承擔有限責任，而社會(huì )投資人在ppp合同中是約定與項目公司承擔連帶責任的。所以項目公司的股權結構變化，并不會(huì )給社會(huì )投資人和項目公司的法律責任形成實(shí)質(zhì)性的改變。只要在項目公司的公司治理和決策權上確保社會(huì )投資人享有決定權并承擔全部責任，即可以保證合同目的的實(shí)現。所以，對于這種違約行為形成對原采購文件和合同的實(shí)質(zhì)性的違反，雙方經(jīng)過(guò)協(xié)商，對合同原約定進(jìn)行必要的變更，并不適合直接確定為實(shí)質(zhì)性的變更，有些變更也應當在正當變更的范疇內。

根據《合同法》規定，一般合同變更只要雙方協(xié)商一致，另行簽訂一份建設工程合同或者補充協(xié)議即可。但就招投標的建設工程而言，根據《招投標法》第四十六條的規定，雙方進(jìn)行的變更不得背離招投標文件和備案合同的實(shí)質(zhì)性?xún)热?，否則會(huì )被認定變更無(wú)效。該條包含了兩層意思：一是建設工程合同的簽訂應當依據招投標文件；二是其他協(xié)議的內容不得違反建設工程合同和招投標文件的實(shí)質(zhì)性?xún)热荨?/p>

但法律法規及司法解釋并未對“背離合同實(shí)質(zhì)性?xún)热?rdquo;作出明確的解釋?zhuān)痉▽?shí)踐中，對于發(fā)包人與承包人通過(guò)補充協(xié)議、會(huì )議紀要、往來(lái)函件、簽證、聯(lián)系單等洽商記錄形式變更工期、工程價(jià)款、結算方式以及工程項目性質(zhì)的，到底是屬于當事人正當變更合同還是變更中標合同的實(shí)質(zhì)性?xún)热輿](méi)有統一的裁判標準。